MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Escherichia coli SE15 plasmid pECSF1

Total Repeats: 2158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013655	ACC	2	6	28	33	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281427818
2	NC_013655	AAGC	2	8	38	45	50 %	0 %	25 %	25 %	281427818
3	NC_013655	CTG	2	6	85	90	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427818
4	NC_013655	GGA	2	6	99	104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281427818
5	NC_013655	AGTG	2	8	105	112	25 %	25 %	50 %	0 %	281427818
6	NC_013655	CGC	2	6	264	269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281427818
7	NC_013655	GGT	2	6	271	276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281427818
8	NC_013655	CAT	2	6	315	320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427818
9	NC_013655	CGG	2	6	371	376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281427818
10	NC_013655	TCG	2	6	399	404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427818
11	NC_013655	CTG	2	6	416	421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427818
12	NC_013655	AGA	2	6	564	569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427818
13	NC_013655	CAC	2	6	576	581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281427818
14	NC_013655	GGCGCT	2	12	594	605	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	281427818
15	NC_013655	CG	3	6	618	623	0 %	0 %	50 %	50 %	281427818
16	NC_013655	CAGGTG	2	12	625	636	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	281427818
17	NC_013655	GTGGCG	2	12	715	726	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	281427818
18	NC_013655	CGA	3	9	798	806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281427818
19	NC_013655	GCC	2	6	838	843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281427818
20	NC_013655	CTG	2	6	844	849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427818
21	NC_013655	GCCGGA	2	12	966	977	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	281427818
22	NC_013655	GAA	3	9	997	1005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427818
23	NC_013655	GAAC	2	8	1011	1018	50 %	0 %	25 %	25 %	281427818
24	NC_013655	ACG	2	6	1031	1036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281427818
25	NC_013655	CTG	2	6	1066	1071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427818
26	NC_013655	GTG	3	9	1147	1155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281427818
27	NC_013655	GTG	2	6	1187	1192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281427818
28	NC_013655	GAT	2	6	1210	1215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427818
29	NC_013655	GAC	2	6	1222	1227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281427818
30	NC_013655	GGA	2	6	1266	1271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281427818
31	NC_013655	CTG	2	6	1285	1290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427818
32	NC_013655	ACGC	2	8	1308	1315	25 %	0 %	25 %	50 %	281427818
33	NC_013655	GCA	2	6	1327	1332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281427818
34	NC_013655	GCA	2	6	1338	1343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281427818
35	NC_013655	CTG	2	6	1363	1368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427818
36	NC_013655	ATT	2	6	1445	1450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427818
37	NC_013655	GAAG	2	8	1476	1483	50 %	0 %	50 %	0 %	281427818
38	NC_013655	TGC	2	6	1524	1529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427818
39	NC_013655	GAC	2	6	1560	1565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281427818
40	NC_013655	TCAG	2	8	1577	1584	25 %	25 %	25 %	25 %	281427818
41	NC_013655	TGG	2	6	1717	1722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281427818
42	NC_013655	CGA	2	6	1727	1732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281427818
43	NC_013655	GAA	2	6	1827	1832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427818
44	NC_013655	CTGG	2	8	1886	1893	0 %	25 %	50 %	25 %	281427818
45	NC_013655	TG	3	6	1895	1900	0 %	50 %	50 %	0 %	281427818
46	NC_013655	CAC	2	6	1901	1906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281427818
47	NC_013655	GCC	2	6	1951	1956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281427818
48	NC_013655	TGA	2	6	1957	1962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427818
49	NC_013655	TGA	2	6	2012	2017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427819
50	NC_013655	ACTGA	2	10	2020	2029	40 %	20 %	20 %	20 %	281427819
51	NC_013655	TGA	2	6	2091	2096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427819
52	NC_013655	CGT	2	6	2098	2103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427819
53	NC_013655	AC	3	6	2110	2115	50 %	0 %	0 %	50 %	281427819
54	NC_013655	GGC	2	6	2182	2187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281427819
55	NC_013655	GGT	2	6	2296	2301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281427819
56	NC_013655	GGT	2	6	2313	2318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281427819
57	NC_013655	GCG	2	6	2328	2333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281427819
58	NC_013655	CACTGG	2	12	2360	2371	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	281427819
59	NC_013655	CAT	2	6	2409	2414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427819
60	NC_013655	AGG	2	6	2433	2438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281427819
61	NC_013655	CGC	2	6	2526	2531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281427820
62	NC_013655	AGA	2	6	2648	2653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427820
63	NC_013655	CCT	2	6	2723	2728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281427820
64	NC_013655	GCA	2	6	2745	2750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281427820
65	NC_013655	GCC	2	6	2830	2835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281427820
66	NC_013655	GAGG	2	8	2843	2850	25 %	0 %	75 %	0 %	281427820
67	NC_013655	TGGCAG	2	12	3036	3047	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	281427820
68	NC_013655	GCA	2	6	3087	3092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281427820
69	NC_013655	AGG	2	6	3094	3099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281427820
70	NC_013655	ACA	2	6	3390	3395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281427821
71	NC_013655	GAA	2	6	3430	3435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427821
72	NC_013655	CT	3	6	3457	3462	0 %	50 %	0 %	50 %	281427821
73	NC_013655	GT	4	8	3469	3476	0 %	50 %	50 %	0 %	281427821
74	NC_013655	GT	3	6	3482	3487	0 %	50 %	50 %	0 %	281427821
75	NC_013655	GGC	2	6	3565	3570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281427821
76	NC_013655	ATCAC	2	10	3834	3843	40 %	20 %	0 %	40 %	281427822
77	NC_013655	ATT	2	6	3854	3859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427822
78	NC_013655	TCC	2	6	3867	3872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	281427822
79	NC_013655	CTCTGA	2	12	3875	3886	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	281427822
80	NC_013655	CTCTGA	2	12	3893	3904	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	281427822
81	NC_013655	CTG	2	6	3908	3913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427822
82	NC_013655	ATT	2	6	3919	3924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427822
83	NC_013655	TGT	2	6	3933	3938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281427822
84	NC_013655	GGCGG	2	10	3972	3981	0 %	0 %	80 %	20 %	281427822
85	NC_013655	CGC	2	6	4075	4080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281427822
86	NC_013655	GCC	2	6	4124	4129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281427822
87	NC_013655	CGT	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427822
88	NC_013655	ACTG	2	8	4266	4273	25 %	25 %	25 %	25 %	281427823
89	NC_013655	T	6	6	4301	4306	0 %	100 %	0 %	0 %	281427823
90	NC_013655	A	6	6	4321	4326	100 %	0 %	0 %	0 %	281427823
91	NC_013655	GCG	2	6	4379	4384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281427823
92	NC_013655	CGT	2	6	4545	4550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427824
93	NC_013655	TTG	2	6	4560	4565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281427824
94	NC_013655	GGGA	2	8	4568	4575	25 %	0 %	75 %	0 %	281427824
95	NC_013655	A	7	7	4575	4581	100 %	0 %	0 %	0 %	281427824
96	NC_013655	CAG	2	6	4612	4617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281427824
97	NC_013655	CTGA	2	8	4619	4626	25 %	25 %	25 %	25 %	281427824
98	NC_013655	A	6	6	4631	4636	100 %	0 %	0 %	0 %	281427824
99	NC_013655	CTG	2	6	4795	4800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427824
100	NC_013655	CCG	2	6	4958	4963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	281427825
101	NC_013655	GAT	2	6	4980	4985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427825
102	NC_013655	CAA	2	6	5062	5067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281427825
103	NC_013655	ATC	2	6	5073	5078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427825
104	NC_013655	TGA	2	6	5090	5095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427825
105	NC_013655	AGGGA	2	10	5181	5190	40 %	0 %	60 %	0 %	281427825
106	NC_013655	ATG	2	6	5236	5241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427825
107	NC_013655	GAT	2	6	5258	5263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427825
108	NC_013655	AAT	2	6	5310	5315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427825
109	NC_013655	ATA	2	6	5410	5415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427825
110	NC_013655	GAAA	2	8	5426	5433	75 %	0 %	25 %	0 %	281427825
111	NC_013655	ATTT	2	8	5458	5465	25 %	75 %	0 %	0 %	281427825
112	NC_013655	AAT	2	6	5528	5533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427825
113	NC_013655	CGT	2	6	5541	5546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427825
114	NC_013655	CAA	2	6	5690	5695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281427825
115	NC_013655	ATA	2	6	5741	5746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427825
116	NC_013655	TTC	2	6	6074	6079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281427826
117	NC_013655	T	6	6	6229	6234	0 %	100 %	0 %	0 %	281427826
118	NC_013655	ATA	2	6	6250	6255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427826
119	NC_013655	TGT	2	6	6286	6291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281427826
120	NC_013655	T	6	6	6538	6543	0 %	100 %	0 %	0 %	281427826
121	NC_013655	ATAA	2	8	7015	7022	75 %	25 %	0 %	0 %	281427827
122	NC_013655	AGA	2	6	7033	7038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427827
123	NC_013655	TAA	2	6	7167	7172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427827
124	NC_013655	CTT	2	6	7177	7182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281427827
125	NC_013655	ATG	2	6	7340	7345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427827
126	NC_013655	TG	3	6	7548	7553	0 %	50 %	50 %	0 %	281427828
127	NC_013655	TAAA	2	8	7593	7600	75 %	25 %	0 %	0 %	281427828
128	NC_013655	AGA	2	6	7714	7719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427828
129	NC_013655	GA	3	6	7734	7739	50 %	0 %	50 %	0 %	281427828
130	NC_013655	TA	3	6	7742	7747	50 %	50 %	0 %	0 %	281427828
131	NC_013655	TCA	2	6	7772	7777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427828
132	NC_013655	GTC	2	6	7821	7826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427828
133	NC_013655	TGT	2	6	7894	7899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281427828
134	NC_013655	T	6	6	7934	7939	0 %	100 %	0 %	0 %	281427828
135	NC_013655	GTT	2	6	8018	8023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281427828
136	NC_013655	CAA	2	6	8055	8060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281427828
137	NC_013655	AG	3	6	8066	8071	50 %	0 %	50 %	0 %	281427828
138	NC_013655	ACAG	2	8	8081	8088	50 %	0 %	25 %	25 %	281427828
139	NC_013655	T	6	6	8135	8140	0 %	100 %	0 %	0 %	281427828
140	NC_013655	TGAG	2	8	8324	8331	25 %	25 %	50 %	0 %	281427829
141	NC_013655	ATC	2	6	8466	8471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427829
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143	NC_013655	T	7	7	8642	8648	0 %	100 %	0 %	0 %	281427830
144	NC_013655	TGA	2	6	8709	8714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427830
145	NC_013655	TGT	2	6	8715	8720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281427830
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148	NC_013655	CT	3	6	8903	8908	0 %	50 %	0 %	50 %	281427830
149	NC_013655	TATT	2	8	8910	8917	25 %	75 %	0 %	0 %	281427830
150	NC_013655	ACCA	2	8	9013	9020	50 %	0 %	0 %	50 %	281427831
151	NC_013655	GCA	2	6	9061	9066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281427831
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153	NC_013655	A	6	6	9154	9159	100 %	0 %	0 %	0 %	281427831
154	NC_013655	CTG	2	6	9214	9219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427831
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156	NC_013655	CAG	2	6	9505	9510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281427832
157	NC_013655	TCA	2	6	9547	9552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427832
158	NC_013655	AT	3	6	9588	9593	50 %	50 %	0 %	0 %	281427832
159	NC_013655	GAA	2	6	9634	9639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427832
160	NC_013655	GTG	2	6	9728	9733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281427832
161	NC_013655	CTGG	2	8	9819	9826	0 %	25 %	50 %	25 %	281427832
162	NC_013655	A	6	6	9853	9858	100 %	0 %	0 %	0 %	281427832
163	NC_013655	AAT	2	6	9868	9873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427833
164	NC_013655	T	7	7	9887	9893	0 %	100 %	0 %	0 %	281427833
165	NC_013655	GTG	2	6	9935	9940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281427833
166	NC_013655	GGT	2	6	9953	9958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281427833
167	NC_013655	AAT	2	6	10055	10060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	281427833
168	NC_013655	CGG	2	6	10075	10080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281427833
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170	NC_013655	CAA	2	6	10099	10104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281427833
171	NC_013655	GAA	2	6	10223	10228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	281427833
172	NC_013655	CCGT	2	8	10287	10294	0 %	25 %	25 %	50 %	281427833
173	NC_013655	CGG	2	6	10356	10361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281427833
174	NC_013655	CCGTG	2	10	10486	10495	0 %	20 %	40 %	40 %	281427833
175	NC_013655	CAGC	2	8	10501	10508	25 %	0 %	25 %	50 %	281427833
176	NC_013655	GCCA	2	8	10511	10518	25 %	0 %	25 %	50 %	281427833
177	NC_013655	GC	3	6	10532	10537	0 %	0 %	50 %	50 %	281427833
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180	NC_013655	GTG	2	6	10744	10749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281427834
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250	NC_013655	GTGA	2	8	13782	13789	25 %	25 %	50 %	0 %	281427839
251	NC_013655	AAC	2	6	13819	13824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281427839
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253	NC_013655	CGG	2	6	13923	13928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281427839
254	NC_013655	A	6	6	14015	14020	100 %	0 %	0 %	0 %	281427840
255	NC_013655	ATTCT	2	10	14024	14033	20 %	60 %	0 %	20 %	281427840
256	NC_013655	AT	3	6	14050	14055	50 %	50 %	0 %	0 %	281427840
257	NC_013655	AAAT	2	8	14069	14076	75 %	25 %	0 %	0 %	281427840
258	NC_013655	TAT	2	6	14118	14123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427840
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260	NC_013655	TA	3	6	14145	14150	50 %	50 %	0 %	0 %	281427840
261	NC_013655	CTG	2	6	14178	14183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427840
262	NC_013655	T	6	6	14197	14202	0 %	100 %	0 %	0 %	281427840
263	NC_013655	TCT	2	6	14207	14212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281427840
264	NC_013655	CTGA	2	8	14275	14282	25 %	25 %	25 %	25 %	281427840
265	NC_013655	TGT	2	6	14321	14326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281427840
266	NC_013655	A	6	6	14332	14337	100 %	0 %	0 %	0 %	281427840
267	NC_013655	ATGCA	2	10	14390	14399	40 %	20 %	20 %	20 %	281427840
268	NC_013655	A	6	6	14578	14583	100 %	0 %	0 %	0 %	281427841
269	NC_013655	TTC	2	6	14646	14651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281427841
270	NC_013655	AAC	2	6	14729	14734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281427841
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272	NC_013655	TTG	2	6	14835	14840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	281427842
273	NC_013655	AGAA	2	8	14897	14904	75 %	0 %	25 %	0 %	281427842
274	NC_013655	AAC	2	6	14962	14967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	281427842
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280	NC_013655	TGC	2	6	15390	15395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427843
281	NC_013655	CG	3	6	15408	15413	0 %	0 %	50 %	50 %	281427843
282	NC_013655	TGGT	2	8	15450	15457	0 %	50 %	50 %	0 %	281427843
283	NC_013655	TAT	2	6	15536	15541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427843
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285	NC_013655	A	7	7	15644	15650	100 %	0 %	0 %	0 %	281427843
286	NC_013655	TGGAAA	2	12	15666	15677	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	281427843
287	NC_013655	ATC	2	6	15689	15694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427843
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290	NC_013655	GAT	2	6	15769	15774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427843
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292	NC_013655	GT	3	6	15844	15849	0 %	50 %	50 %	0 %	281427843
293	NC_013655	GGA	2	6	15850	15855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	281427843
294	NC_013655	CTG	2	6	16004	16009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	281427843
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298	NC_013655	G	6	6	16179	16184	0 %	0 %	100 %	0 %	281427843
299	NC_013655	TCT	2	6	16214	16219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	281427843
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372	NC_013655	ATT	2	6	19878	19883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	281427847
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377	NC_013655	T	6	6	20060	20065	0 %	100 %	0 %	0 %	281427847
378	NC_013655	TGA	2	6	20067	20072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	281427847
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380	NC_013655	AC	3	6	20185	20190	50 %	0 %	0 %	50 %	281427848
381	NC_013655	AGC	2	6	20212	20217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281427848
382	NC_013655	GA	3	6	20242	20247	50 %	0 %	50 %	0 %	281427848
383	NC_013655	CAG	2	6	20346	20351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281427848
384	NC_013655	ACC	2	6	20499	20504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281427848
385	NC_013655	TGG	2	6	20605	20610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	281427848
386	NC_013655	CAT	2	6	20633	20638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	281427848
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388	NC_013655	CGG	2	6	20950	20955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281427849
389	NC_013655	GGC	2	6	20960	20965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	281427849
390	NC_013655	CAC	2	6	20980	20985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	281427849
391	NC_013655	TTCA	2	8	21071	21078	25 %	50 %	0 %	25 %	281427849
392	NC_013655	GCA	2	6	21130	21135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281427849
393	NC_013655	GCA	2	6	21145	21150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	281427849
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